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白羽肉雞雞苗均價 占山為王:噬菌體編碼蛋白防御宿主細菌被其他噬菌體感染

發(fā)布日期:2022-01-12 發(fā)布人:潤達生物

?噬菌體是一種感染細菌的病毒,雖然噬菌體對人體(及其他真核細胞生物)無害,但它對細菌而言可能是致命的,因為很多噬菌體感染后劫持細菌進行繁殖,最終裂解并殺死宿主細菌。

噬菌體是一種感染細菌的病毒,雖然噬菌體對人體(及其他真核細胞生物)無害,但它對細菌而言可能是致命的,因為很多噬菌體感染后劫持細菌進行繁殖,最終裂解并殺死宿主細菌。

噬菌體是一種感染細菌的病毒,雖然噬菌體對人體(及其他真核細胞生物)無害,但它對細菌而言可能是致命的,因為很多噬菌體感染后劫持細菌進行繁殖,最終裂解并殺死宿主細菌。噬菌體療法——即利用噬菌體特異性殺菌——已成為對抗對致病性耐藥細菌的重要手段。 

噬菌體個性化治療蓬勃興起的同時,同樣面臨許多挑戰(zhàn),原噬菌體是其中之一。自然界中噬菌體與細菌并非全是你死我活的關系,相互利用是它們的共存策略之一。與裂解性噬菌體不同,原噬菌體侵入細菌細胞后并不裂解宿主,而是將其基因組整合到宿主菌的基因組上,這些噬菌體的基因組還保留編碼蛋白的功能。越來越多的研究表明,有些原噬菌體編碼蛋白被其宿主細菌用于對抗自己的宿主(如一些噬菌體蛋白有助于細菌感染人類)。另一些對分枝桿菌和銅綠假單胞菌的研究表明,原噬菌體編碼蛋白則可以抑制其宿主菌被其他噬菌體感染。 

據(jù)美國利哈伊大學生物科學系Vassie C. Ware教授稱,許多病原細菌中都含有原噬菌體,有些原噬菌體可能參與到細菌的防御系統(tǒng),使噬菌體治療更具挑戰(zhàn)性。噬菌體治療所用的裂解性噬菌體為了能殺滅這類病原細菌,還需要克服靶細菌所含原噬菌體的防御系統(tǒng)。 

Vassie C. Ware教授團隊與前同事(現(xiàn)桑迪亞國家實驗室)Javier Buceta 教授團隊最近合作開展了一項研究,該研究以恥垢分枝桿菌標準株mc2155及其噬菌體Butters為模型。前者因致病力弱、生長相對快速,是研究分枝桿菌(包括引起結核病的結核分枝桿菌及膿腫分枝桿菌等其他致病性非結核分枝桿菌)的模式菌株。Butters噬菌體是由SEA-PHAGES夏令營學員Lena Ma于2012年在利哈伊的一處土壤樣本中發(fā)現(xiàn)。 

SEA-PHAGES (Science Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science):由美國匹茲堡大學Graham Hatfull教授團隊開展的面向高中生的噬菌體分離和基因分析夏令營。 

該合作團隊發(fā)現(xiàn)了一個由 Butters 原噬菌體基因組成的雙組分系統(tǒng),這些基因編碼的蛋白質相互“協(xié)作”以阻止某些噬菌體的侵入和感染。研究者發(fā)現(xiàn),雖然 Butters 原噬菌體不能保護細菌細胞免受所有噬菌體攻擊,但Butters 原噬菌體防御系統(tǒng)中存在針對不同噬菌體類型的不同防御系統(tǒng)。這一成果于2020年10月發(fā)表在美國微生物學會期刊 mSystems 上。

“我們團隊與其他合作者的先前研究表明,原噬菌體表達的基因可以保護其細菌宿主免受某些特定噬菌體群體的感染。而原噬菌體Butters是不是也有類似機制及如何作用還尚未有研究,” Ware教授說?!巴ㄟ^我們的研究,我們希望確定參與防御幾種噬菌體感染的基因,但沒想到發(fā)現(xiàn)兩種蛋白質之間的相互作用會影響其中一種蛋白質在防御中的功能?!?nbsp;

Butters原噬菌體隸屬N簇分支桿菌噬菌體,已有研究表明一些N簇原噬菌體通過基因組中心可變區(qū)基因介導宿主對其他異型噬菌體的防御。Graham Hatfull教授團隊2019年發(fā)表于mBio雜志的論文發(fā)現(xiàn)I簇/ I2亞簇分枝桿菌前噬菌體Sbash可變區(qū)30和31號基因編碼蛋白(gp30和gp31)參與介導細菌防御)。通過生物信息學分析,Ware教授團隊發(fā)現(xiàn)原噬菌體Butters的gp30和gp31基因也位于可變區(qū)域,它們在Butters噬菌體的溶源性周期表達,使它們成為這項研究的候選基因。 

通過噬菌體成斑實驗,該團隊發(fā)現(xiàn)Butters噬菌體的gp30和gp31基因在防御異型噬菌體感染中發(fā)揮了關鍵作用。研究者通過免疫熒光顯微鏡和免疫沉淀實驗,證明這2個基因編碼蛋白可相互作用。它們組成的雙組分系統(tǒng)可幫助宿主細菌抵御PurpleHaze(A簇/ A3亞簇)和Alma(A簇/ A9亞簇)噬菌體感染,但不足以抵御Island3(I簇/ I1亞簇)噬菌體感染(圖1)。 


原噬菌體Butters編碼蛋白防御其他噬菌體攻擊的模式假設圖


圖1. 原噬菌體Butters編碼蛋白防御其他噬菌體攻擊的模式假設圖 

分枝桿菌噬菌體Butters編碼的蛋白gp30和gp31在宿主細菌的細胞膜上結合。當其他噬菌體感染該細菌時,會觸發(fā)gp30蛋白釋放到細胞質中,變成活化狀態(tài),促使細菌對抗噬菌體的感染。除了gp30和gp31,Butters噬菌體的基因組可變區(qū)還編碼另外3種膜蛋白(gp33、gp35、gp36)和2種細胞質蛋白(gp32、gp34),它們是否介導噬菌體參與的宿主防御尚未可知。 

“總的來說,這些研究數(shù)據(jù)使我們能夠構建一個預測模型來描述Butters原噬菌體雙組分系統(tǒng)如何在防御特定噬菌體攻擊方面發(fā)揮作用”,Ware教授說,“原噬菌體存在的多樣性防御機制,使得建立用于噬菌體治療的廣譜噬菌體雞尾酒組更具挑戰(zhàn)性?!?nbsp;

除了為噬菌體治療提供借鑒外,該研究對于構建可用于食品工業(yè)等生物技術領域的抗噬菌體工程細菌也具有借鑒意義。(文章來源:上海噬菌體與耐藥研究所)