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背景：許多自身免疫性疾病是由復(fù)雜的遺傳和環(huán)境因素及其相互作用引起的。其中自身免疫疾病的遺傳因素通過各種研究揭示，例如全基因組關(guān)聯(lián)研究。腸道微生物群，指的是定居在我們腸道內(nèi)的微生物群落，通過免疫和代謝系統(tǒng)對我們的健康產(chǎn)生重大影響。隨著分析方法的進(jìn)步，許多研究揭示了腸道微生物群與人類疾病如代謝性疾病、癌癥、腸道疾病之間的復(fù)雜關(guān)系。至于自身免疫疾病，腸道微生物群被認(rèn)為是其發(fā)展過程中最重要的貢獻(xiàn)者之一。

目的：既往已經(jīng)深入的研究了自身免疫性疾病與腸道微生物群的關(guān)系，并確定了幾種與自身免疫相關(guān)的細(xì)菌類群。然而，對腸道病毒在自身免疫性疾病中的作用知之甚少。

方法：在此，我們對476名日本人進(jìn)行了全腸道病毒體測序分析，這些日本人包括類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者、系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者、多發(fā)性硬化患者和健康對照受試者。

結(jié)果：我們對病毒豐度的病例對照比較顯示，在自身免疫性疾病患者，特別是類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)和系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者的腸道中，作為健康腸道病毒主要成分之一的crAss樣噬菌體顯著減少。此外，SLE患者腸道中的Podoviridae明顯減少。為了了解這些病毒是如何影響細(xì)菌體的，我們進(jìn)行了定量的病毒-細(xì)菌關(guān)聯(lián)分析，并進(jìn)行了病毒-細(xì)菌相互作用分析。結(jié)果顯示，Podoviridae和Faecalibacterium豐度之間存在正相關(guān)，基于CRISPR的病毒-細(xì)菌相互作用分析提供了噬菌體感染的直接證據(jù)。擬桿菌門(Bacteroidetes)和厚壁菌門(Firmicutes)，包括Ruminococcus spp，檢測為crAss樣噬菌體的宿主，這些噬菌體在多個(gè)樣本中復(fù)制。

結(jié)論：我們的數(shù)據(jù)表明腸道病毒可以直接或通過細(xì)菌影響我們的身體。我們的分析闡明了先前缺失的與自身免疫相關(guān)的腸道微生物群，并提出了有助于自身免疫疾病發(fā)展的新候選基因。

原文出處：TomofujiY,KishikawaT,MaedaY,et al.Whole gut virome analysis of 476 Japanese revealed a link between phage and autoimmune disease.Ann Rheum Dis2021 Dec 08