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抗生素會拖噬菌體的“后腿”嗎?

發(fā)布日期:2022-09-19 發(fā)布人:潤達生物

2021年9月7日在 PHAVES系列研討會中,德國Forschungszentrum Jülich(尤里希研究中心)的博士生A?l Hardy 談到了他對氨基糖苷類抗生素抑制噬菌體感染的研究。

2021年9月7日在 PHAVES系列研討會中,德國Forschungszentrum Jülich(尤里希研究中心)的博士生A?l Hardy 談到了他對氨基糖苷類抗生素抑制噬菌體感染的研究。
背景
氨基糖苷類抗生素(AGs)是從革蘭氏陽性菌屬鏈霉菌中提取出的,由氨基糖與氨基環(huán)醇通過氧橋連接而成的苷類抗生素。根據(jù)來源可分為:天然氨基糖苷類(如由鏈霉菌屬培養(yǎng)液中提取獲得的鏈霉素、卡那霉素、妥布霉素、新霉素、大觀霉素等,由小單孢菌屬培養(yǎng)液中提取獲得的慶大霉素、西索米星、小諾米星等),半合成氨基糖苷類(阿米卡星、奈替米星等)。今天廣泛使用的一種抗生素——鏈霉素,是第一個分離的氨基糖苷類抗生素。
2018年研究人員使用具有抗鏈霉素活性的菌株分離出五種不同的噬菌體,之前的報告和觀察表明氨基糖苷類抗生素可能抑制噬菌體感染。
氨基糖苷類可以抑制一系列噬菌體感染
為了確定氨基糖苷類抗生素和噬菌體之間的相互作用,分別在使用和不使用不同氨基糖苷類抗生素的情況下,用噬菌體侵染對氨基糖苷類抗生素具有抗性的細菌菌株。結(jié)果顯示:在不使用氨基糖苷類抗生素的情況下,能夠觀察到噬菌斑的形成;而在使用氨基糖苷類抗生素的情況下,未觀察到噬菌斑的形成,這表明氨基糖苷類抗生素抑制噬菌體感染。
研究者使用多種宿主菌和多種噬菌體進行重復(fù)實驗,觀察到類似的結(jié)果,這表明氨基糖苷類抗生素在廣泛的宿主(革蘭氏陽性細菌和革蘭氏陰性細菌)中抑制噬菌體感染。
研究者使用液體培養(yǎng)法也進行了重復(fù)實驗,發(fā)現(xiàn)當噬菌體感染宿主菌時,細菌菌液濃度會大大降低。但當加入氨基糖苷類抗生素后,細菌生長曲線恢復(fù)正常,細菌菌液濃度增加。
安普霉素通過阻止噬菌體基因組的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄發(fā)揮作用
安普霉素是一類氨基糖苷類抗生素,可完全抑制鏈霉菌噬菌體感染。研究者將生產(chǎn)安普霉素用過的廢料加入到噬菌體中,廢料與純化后的安普霉素具有相同的抑制噬菌體感染的效果。為了進一步確定噬菌體生命周期的哪個步驟被安普霉素抑制,研究者又進行了以下實驗。
鉀流出試驗:觀察安普霉素是否影響噬菌體 DNA 的注入。實驗發(fā)現(xiàn)安普霉素對噬菌體吸附或 DNA 注入沒有影響。
qPCR驗證:使用qPCR能夠測量細胞內(nèi)噬菌體DNA濃度隨培養(yǎng)時間的變化,觀察安普霉素是否影響噬菌體復(fù)制。實驗發(fā)現(xiàn)噬菌體DNA濃度隨著培養(yǎng)時間增加呈指數(shù)增長,但當添加安普霉素時,噬菌體DNA濃度增加得更早,增加的程度較小。
測序+轉(zhuǎn)錄組學(xué):在噬菌體感染期間,研究者還使用全基因組測序來觀察轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化。結(jié)果顯示對照組和安普霉素組之間的轉(zhuǎn)錄讀數(shù)存在顯著差異。這些實驗使研究人員確定安普霉素阻止了噬菌體基因組的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄,熒光實驗觀察到的結(jié)果進一步支持了這一點。
結(jié)論:氨基糖苷類抗生素通過直接影響噬菌體的生命周期而不是它的其他抗菌活性來抑制噬菌體感染。
展望
氨基糖苷類抗生素只是最近發(fā)現(xiàn)的一種抗噬菌體分子,未來的工作應(yīng)該探索更多的抗噬菌體分子,因為這些分子可能對噬菌體治療產(chǎn)生負面影響。
在擬定使用噬菌體和抗生素共同抗感染治療時,應(yīng)測定所使用的噬菌體對氨基糖苷類抗生素的敏感性。(文章來源:上海噬菌體與耐藥研究所)